La transformation de la proteïne NS23 en protéïne NS2 et NS3 (ancienne gp80) explique le passage d'une souche de virus du biotype non cytopathogène (NCP) en virus cytopathogène (CP).
Seules les souches NCP seraient à l'origine d'une virémie, et infectent les cellules sanguines, le système nerveux, où le tractus respiratoire. Ce sont ces souches qui peuvent être à l'origine de la création d'IPI.
Le veau IPI contaminé par une souche IPI à l'état de foetus, finira par déclencher une maladie des muqueuses dans sa forme la plus caractéristique, à cause de l'apparition par mutation d'une souche CP.
Ce qui explique que l'on retrouve essentiellement ces souches CP dans les prélèvements intestinaux.